Předpokládané příčiny snížené funkce ŠŽ:
1. Autoimunitní nemoci. Nejčastější choroby této skupiny nemocí jsou Hashimotova nemoc a Graves-Basedowowa choroba. V lidském těle se začnou vytvářet protilátky poškozující štítnou žlázu kde vzniká chronický zánětlivý proces. V začátcích nemoci dochází ke zvýšení funkcí štítné žlázy, nasazujeme Štítná žláza - při hyperfunkci a Autoimunol na harmonizaci imunitního systému. Nemoc časem vyčerpá díky vleklému zánětu tkáně štítné žlázy způsobí snížení její funkce. V tomto stádiu nasazujeme Štítná žláza - při hyperfunkci, Autoimunol a Irský mech na zánět ŠŽ.
2. Subakutní (pozvolnější) zánět ŠŽ je způsoben pravděpodobně viry. Vyskytuje se poměrně často a postihuje především ženy. Často navazuje přímo nebo s krátkým časovým odstupem na virové onemocnění dýchacích cest. Ale může se objevit i bez této vazby na tuto infekcí. Nasazujeme Herpestop na virový zánět a Štítná žláza - při hypofunkci.
3. Nedostatek jódu dnes již není tak častý. Nasazujeme Štítná žláza - při hypofunkci.
4. Poškození mozku (úrazem, cévními mozkovými příhodami, nádorem mozku, zánětlivými procesy atd) či nádor ŠŽ jsou dle současných znalostí mimo možnosti fototerapie.
Dnes klasická medicína nemoc řeší podáváním hormonů štítné žlázy (např. léky Euthyrox, Letrox). Je ale nezbytné zjistit vlastní příčinu nemoci a soustředit se na tyto příčiny.